Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms