Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF558Q96NG5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms