Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF560Q96MR9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF560Q96MR9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms