Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms