Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87BQ96K49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms