Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERAC1Q96JX3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms