Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COG3Q96JB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms