Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC41A3Q96GZ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms