Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms