Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7LQ96GN5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA7LQ96GN5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms