Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC4Q96FT7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms