Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms