Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD4Q96DM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms