Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBGCP3Q96CW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms