Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C12orf43Q96C57 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C12orf43Q96C57 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms