Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms