Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NKD1Q969G9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKD1Q969G9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms