Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFKQ969G6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms