Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PEX13Q92968 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX13Q92968 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX13Q92968 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX13Q92968 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX13Q92968 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX13Q92968 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX13Q92968 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms