Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXB13Q92826 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms