Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H4Q92791 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms