Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOMQ8WWX9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms