Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf54Q8WWF1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf54Q8WWF1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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