Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms