Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms