Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms