Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC110Q8TBZ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms