Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms