Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00116Q8NCU8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms