Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms