Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC63Q8NA47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms