Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C12orf29Q8N999 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C12orf29Q8N999 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf29Q8N999 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms