Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms