Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS8Q8N3P4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VPS8Q8N3P4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VPS8Q8N3P4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms