Protein–RNA interactions for Protein: Q8N328

PGBD3, PiggyBac transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD3Q8N328 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD3Q8N328 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD3Q8N328 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms