Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPUSD2Q8IZ73 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms