Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms