Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms