Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SKAP1Q86WV1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms