Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms