Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PKD1L3Q7Z443 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD1L3Q7Z443 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD1L3Q7Z443 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD1L3Q7Z443 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD1L3Q7Z443 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD1L3Q7Z443 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms