Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms