Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms