Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms