Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms