Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms