Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms