Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBR3Q6ZT12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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