Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM136Q6ZRR5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms