Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT7Q6ZNI0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT7Q6ZNI0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms